广州医学院第三附属医院的各专业门类设置较为齐全，设有18个临床一级科室，开设专科门诊90多个，专家门诊120多个。妇产科是广东省卫生厅特色专科、广州市卫生局确立的重点专科，同时也是广东省确认的广州医学院妇产科硕士研究生点组长单位。
广州市妇产科研究所设施一流，主要从事妇产科疾病诊疗、辅助生殖技术、HLA(人类白细胞抗原)与器官移植、遗传学检查及产前诊断等的工作，开展的围产医学、遗传优生、人类生殖研究已跨入国内先进水平。是卫生部已经批准可以开展人类辅助生殖技术的广州最早的两家医院之一。
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特色专科 ：产科 骨外科 心血管内科 肾移植科 妇科
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