复旦大学附属儿科医院创建于1952年，系卫生部部属“三级甲等”医院，是集医教研为一体的综合性儿童专科医院。全国儿科学重点学科、国家“211工程”重点建设单位。最早被国家授予儿科学硕士、博士学位授权点、临床医学(儿科学组)博士后流动站的单位。多次被评为上海市文明单位。医院定位：立足上海、服务全国、辐射亚洲。目标成为中国及亚洲儿童医学中心之一;成为儿科医学教育向全国辐射的中心;成为国际儿科学术交流的主要桥梁。
医院专业设置齐全，是上海市第一家小儿涉外特需医疗中心和亚洲国际救援中心。呼吸急救专业是上海市医学领先专业重点学科，小儿外科是上海市小儿外科疑难重症诊治中心，还设有上海市性早熟中医特色门诊。共有39个临床和医技科室，主要专业涉及儿内科(新生儿、呼吸、消化、血液、肾脏、神经、内分泌、免疫、遗传等)、儿外科(普外、泌尿、骨科、新生儿外科、肿瘤、神经外科)、心血管中心、传染科、急救科、麻醉科、中医科、眼耳鼻喉科、皮肤科、口腔科和儿童保健及康复科等。为适应临床发展需要，先后设立了疑难病诊治中心、癫痫中心、遗尿中心、哮喘诊疗中心、小儿微创外科中心、复旦大学小儿肾脏病和泌尿系统疾病诊治中心。医院拥有先进的医疗检测设备和检验技术，为一流的诊疗提供技术保障。
建院之初主要以诊治儿童内科疾病为主，在开设内科门急诊及病房的同时，设立放射、药剂、化验室等辅助科室。党的十一届三中全会以来，医院恢复了正常的医、教、研秩序，为了更好的发展特色专业，体现各专业的综合优势，使一些特殊专业得到进一步发展，将传染病专业、急救专业从内科中分离，分别于1983年成立传染科，1984年成立急救专业。小儿急救专业在国内率先采用气管插管机械通气抢救小儿呼吸衰竭，训练和培养监护室医师护士进行呼衰病孩的气道护理，以及应用心电呼吸监护仪对危重病孩进行监护，提高了重危病人抢救成功率，使病死率降至6%以下。1988年成立内分泌专业，使单一的内科发展为10个专业组及专业病房。八十年代医院承担国家“七•五”攻关课题4项，国家自然科学基金2项，省部级和上海市卫生局课题33项。以新生儿疾病、小儿肾脏疾病的研究和儿童保健方面的研究工作为主。并先后获得卫生部科技进步奖11项，上海市科技成果奖10项。
在医疗、教学、科研全面发展的基础上，医院与世界各国的学术交流日益频繁，已先后与英国、美国、加拿大、瑞典、澳大利亚、香港等国家和地区建立了长期稳定的学术交流与合作关系，多渠道、多领域地进行友好往来。每年有各类外宾来院讲学50余次，有20余人次出国访问和进行学术交流，选派中青年医务护理人才出国进修学习。成功主办两届上海国际儿科学术会议，亚太地区小儿内分泌学习班。同时医院注重加强与国内兄弟医院的交流与合作，先后与国内10余所医院建立了友好关系，定期派出专家进行学术讲座和技术支持，并为我国云南、新疆等贫困地区医疗给予无偿支援和帮助，获得了国内外同行的赞誉。
医院有16人在全国学术机构中任领导职务，是中华医学会儿科分会副主任委员单位。医院注重人才培养与学科梯队建设，每年选送各类中青年业务骨干出国培养，现拥有全国“长江学者奖励计划”唯一儿科学特聘教授1人、全国中青年科技之星2人、曙光计划3人、百人计划3人、启明星计划1人。1988年被国家教委批准为全国儿科学重点学科;曾先后获得上海市先进教学集体和上海市优秀教学奖;1995年被评为卫生部“三级甲等”医院;1997年列为国家 “211工程”重点学科;1998年首批批准为教育部“长江学者奖励计划”特聘教授岗位单位;1999年6月小儿呼吸急救专业被评为上海市医学领先专业。
五十年历经磨砺，儿科医院在岁月的洗礼中历久弥坚，逐步确立了在全国儿科学界的领先地位，享誉海内外。医院本着“以人为本、发扬特色，为儿童提供全方位、高质量健康医疗服务”的办院宗旨，树立“热情、尊重、平等对待每一位服务对象”的服务理念，崇尚“爱院如家、勤奋敬业、团结合作、科技创新”的医院精神，将引领儿童医学、科学研究和教育发展，提高儿童健康水平。
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